Капітальний ремонт м'якої покрівлі може включати в себе: ремонт старого покрівельного килима, розтин бульбашок, ревізію або заміну водоприймальних воронок, відновлення, заміну карнизних звисів і покриттів парапетів, ремонт місць примикань, ґрунтування старого покрівельного килима і наплавлення одного або двох нових шарів покрівельного матеріалу.
Найбільш проблемними місцями плоских покрівель є: примикання покрівлі до стін і парапетів, місця проходу через покрівлю різного роду труб, місця встановлення водоприймальних лійок. Саме цим елементам покрівлі, їх правильного та якісного виконання слід приділяти особливу увагу при будь-якому ремонті м'якої покрівлі. Також, роблячи ремонт м'якої покрівлі, велике значення варто приділяти підготовці основи під укладання водоізоляційного килима.